Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLN3Q13286 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLN3Q13286 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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