Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLFQ13129 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLFQ13129 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms