Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXF2Q12947 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXF2Q12947 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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