Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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