Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SYCNQ0VAF6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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SYCNQ0VAF6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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