Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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PUDPQ08623 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PUDPQ08623 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PUDPQ08623 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PUDPQ08623 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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