Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOS1Q07889 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms