Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF8Q02556 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms