Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RELBQ01201 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RELBQ01201 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RELBQ01201 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RELBQ01201 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RELBQ01201 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RELBQ01201 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms