Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2C1P98194 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2C1P98194 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms