Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GNB1P62873 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GNB1P62873 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GNB1P62873 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GNB1P62873 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GNB1P62873 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms