Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms