Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ACTBP60709 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ACTBP60709 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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