Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVPABLB-1P60509 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms