Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NLRP12P59046 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NLRP12P59046 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NLRP12P59046 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NLRP12P59046 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms