Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTTPP55157 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTTPP55157 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTTPP55157 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms