Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms