Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms