Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCT3P49368 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCT3P49368 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT3P49368 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT3P49368 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms