Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms