Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC19A1P41440 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC19A1P41440 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms