Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5C1P36542 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms