Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD13P35453 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms