Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms