Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms