Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms