Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PLNP26678 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PLNP26678 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PLNP26678 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms