Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNMT1P26358 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms