Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USF1P22415 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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