Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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