Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms