Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIP12755 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIP12755 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIP12755 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms