Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms