Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms