Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms