Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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