Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF208O43345 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms