Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9YO00507 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms