Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVV-1B6SEH8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms