Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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