Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC162PA2VCL2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms