Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD54BQ9Y620 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD54BQ9Y620 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms