Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA4Q9Y5G9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA4Q9Y5G9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms