Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRRAPQ9Y4A5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRRAPQ9Y4A5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms