Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC4Q9Y296 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC4Q9Y296 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC4Q9Y296 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms