Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
L1RE1Q9UN81 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms