Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH9Q9ULB4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH9Q9ULB4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH9Q9ULB4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms