Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN4Q9UHM6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OPN4Q9UHM6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms