Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUFIP1Q9UHK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUFIP1Q9UHK0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms