Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKX1-2Q9UD57 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX1-2Q9UD57 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms